Diário de um Químico Digital 3.0

Química, TICs e outras treconologias. :)

A Química dos produtos naturais (parte 3) — 22/03/2013

A Química dos produtos naturais (parte 3)

Veja as partes 1 e 2 aqui!

A Química dos produtos naturais (parte 2) — 08/03/2013

A Química dos produtos naturais (parte 2)

Como eu prometi no post da quarta-feira passada, aqui vai a parte 2 do podcast.

Então, já sabem, é só clicar no botão “cc” e assistir ao vídeo com legendas (em inglês ou traduzidas automaticamente para o português).

A Química dos produtos naturais (parte 1) — 06/03/2013

A Química dos produtos naturais (parte 1)

Esse vídeo é o primeiro de uma série de podcasts do canal Chemical Abstracts Services no youtube.

Cliquem no botão “cc” para legendas automáticas do vídeo.

Sexta-feira vem a segunda parte do podcast.

Aguardem.

P.S.:Você pode encontrá-los também no facebook, basta procurar pela página SciFinder.1

Molécula do dia – d-tubocurarina — 27/02/2013

Molécula do dia – d-tubocurarina

A d-tubocurarina é um alcaloide. Foi isolada em 1945 por J.D. Dutcher a partir da casca de uma planta trepadeira cujo nome científico é Chondrodendron tomentosum.
 A d-tubocurarina é o ingrediente ativo do curare, um veneno usado por índios para envenenar pontas de flechas que, ao atingir uma presa, deixam-nas completamente paralisadas.

Já foi utilizado como relaxante de músculos esqueletais em associação com anestésicos, mas atualmente ele foi substituído por drogas mais seguras.

Curiosidade:

 No livro de Ian Flemming “From Russia with Love”, a personagem Rosa Klebb envenena James Bond com tetrodoxina. Em outro livro “O satânico Dr No”, Bond é curado de um envenenamento pelo curare, veneno do qual a simpática molécula de hoje é o componente principal.

Mais aspectos químicos e biológicos, na sequência do post.
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Chondrodendron tomentosum é uma planta da família Menispermaceae, nativa do Brasil, Bolívia, Peru, Guiana, Equador, Panamá e Colômbia. Trata-se de uma trepadeira de crescimento rápido e podendo alcançar alturas de até 30 metros.

taxonomia da planta:

Domínio: Eukaryota

Reino: Plantae

Sub-reino: Viridaeplantae

Filo: Tracheophyta 

Sub-filo: Euphyllophytina

Infrafilo: Radiatopses 

Classe: Spermatopsida 

Sub-classe: Ranunculidae 

Superorder: Ranunculanae 

Ordem: Ranunculales 

Família: Menispermaceae 

Tribo: Pachygoneae 

Gênero: Chondrodendron 

Nome botânico: – Chondrodendron tomentosum 

aspectos químicos:

 Quando usada medicinalmente, apresenta-se sob a forma de cloridrato pentahidrato.

fórmula química:

C37H42Cl2N2O6.5H2O

fórmula estrutural plana:

 Nome sistemático (IUPAC): 6,6′-dimetoxi-2,2,2′,2′-tetrametiltubocuraran-2,2′-diium-7′,12′-diol

Massa molar: 624.765 g/mol

 E era isso, por hoje chega!
FONTES: 12 e 3
Desenhando moléculas com o ACD/ChemSketch — 04/12/2012

Desenhando moléculas com o ACD/ChemSketch

Exemplo_p_02

Eu já havia produzido um enorme tutorial de como desenhar moléculas com o falecido SymyxDraw (ele foi rebatizado de AccelrysDraw), mas os alunos do curso de Ciências da UFFS me desafiaram a ministrar uma oficina durante a III Semana Acadêmica e lá fui eu a produzir um material inédito.

A apresentação abaixo é fruto desse desafio e, como eu sempre faço, compartilho o meu trabalho com vocês meus anônimos leitores.

A ideia é que o tutorial não pare por aí e a parte dos screencasts seja gradualmente melhorada.

Esperem novidades com respeito a esse material.

Bom, chega de trolóló, lá vai o tutorial.

Molécula do dia – Aspirina (Ácido AcetilSalicílico) — 29/11/2012

Molécula do dia – Aspirina (Ácido AcetilSalicílico)

Dica de site – chemicalize.org — 12/03/2012

Dica de site – chemicalize.org

Encontrei esse site bem interessante na minha caixa de e-mails hoje de manhã.

Resolvi conferir para ver se era tudo que a empresa que o criou dizia ser.

Olha, fiquei bem interessado pelas potencialidades do Chemicalize.

Vamos dar uma olhada no screenshot que eu tirei dele:

Chemicalize1

Só pelo layout básico já dá para ver que o serviço de procura por moléculas que ele oferece é bem completo.

Para quem trabalha com design de fármacos, ele oferece opções relativas a estrutura/atividade (regras de Lipinski), pKa (acidez), logP, cargas, polarizabilidade, ponto isoelétrico, etc.

Para os químicos sintéticos, ele oferece a possibilidade de consultar os isômeros e tautômeros da molécula em questão, geometria, área polar superficial, área acessível ao solvente, etc.

Sem contar que ele que ele fornece os nomes da molécula de acordo com a IUPAC e com a nomenclatura usual.

Chemicalize2

E, como se não bastasse tudo isso, ele oferece páginas da Web que citam a molécula pesquisada, algumas até apontando para artigos que a citam.

Ah, está interessando em descobrir moléculas similares à pesquisada?

Sem problemas, o Chemicalize auxilia nesse particular também.

Chemicalize3

Basta selecionar a aba “Similarity” (na figura acima a aba está sinalizada pela seta vermelha) e aguardar que o site faça a procura das estruturas relacionadas.

Ah, mas eu preciso desenhar uma estrutura química e não tenho nenhum software instalado no computador.

Bom, se você não quiser instalar um (tenho uma excelente opção para você nesse link aqui), então clique no mesmo local que a aba sinalizada com uma seta vermelha na figura abaixo indica.

Chemicalize4

Bom, não tem desculpa para não encontrar a molécula que o professor pediu para você pesquisar para aquela disciplina safadinha do mestrado/doutorado.

Resolva seus problemas com o chemicalize.

Obrigado pela leitura e até a próxima dica de site! 

Química orgânica é… — 30/12/2011

Química orgânica é…

…quase como um Lego, você escolhe a peça que quer, tira a que não quer mais e encaixa na peça central.

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Bom final de ano para todos!

Dica: Construtor de isômeros online — 06/12/2011

Dica: Construtor de isômeros online

Olha, perdi uns bons minutos montando estruturas de alcanos nesse site.

Recomendo fortemente o construtor de isômeros online.

Isomer_construction_set

Para acessá-lo, clique AQUI.

Moléculas com nomes e formas “divertidas” — 18/11/2010

Moléculas com nomes e formas “divertidas”

sgraber:  Molecules with Silly or Unusual Names - page 4

Próximo post eu falo sobre os nanoputianos!

 

FONTE